Ele genoma da varíola de macaco (Monkey Pox) foi obtido por pesquisadores do Instituto de Saúde Carlos III (ISCIII), que conseguiram o primeiro rascunho da sequência completa do vírus a partir da análise genômica de amostras de 23 pacientes. Este enorme trabalho de sequenciamento confirma que a variedade da África Ocidental é a causa deste surto.
Além disso, o sequenciamento atingiu 100% de cobertura dos 190.000 pares de bases do genoma deste vírus, o que abre a possibilidade de estudos filogenéticos mais avançados que permitirão obter informação adicional sobre o seu comportamento e uma melhor compreensão da sua origem, circulação e difusão. Esta é uma das sequências mais completas obtidas até hoje.
O sequenciamento realizado pelo Laboratório de Arbovírus do ISCIII, em conjunto com as unidades de Genômica e Bioinformática do ISCIII, teve as referências publicadas nos últimos dias por outros países (Bélgica, Alemanha, Portugal e EUA), e se baseou em uma tecnologia genômica de nova geração mapeada contra o genoma de referência, ao qual foi adicionada uma análise complementar das amostras usando uma técnica conhecida como montagem de novo.
Mesmo surto em 36 países
As sequências brutas foram concluídas na noite de segunda-feira passada e a análise computacional foi realizada nas últimas 36 horas. Os resultados indicam que as amostras sequenciadas parecem pertencer ao mesmo surto detectado em outros países europeus., uma vez que os genomas obtidos dificilmente diferem daqueles já sequenciados em outros países; Especificamente, a análise realizada no ISCIII conclui que existem menos de 5 SNPs – sequências genéticas denominadas mudanças de nucleotídeo único – diferentes do sequenciamento realizado na Alemanha.
Os resultados indicam que as amostras sequenciadas parecem pertencer ao mesmo surto detectado em outros países europeus.
O sequenciamento confirma que o vírus da varíola símia no surto ocorrido na Espanha é do subtipo da África Ocidental, que é o menos virulento entre os conhecidos e o que foi identificado até agora na maioria dos países fora da África implicados neste surto. Os clados são grupos filogenéticos que definem a evolução biológica de um organismo, que explicam como ele age e se comporta, e neles podem ser observadas as diferenças genéticas dos vírus circulantes,
Comparação entre países
Depois de obter a sequência completa do vírus, várias equipes de pesquisadores do ISCIII estão realizando análises filogenéticas para descobrir a relação entre as amostras espanholas e as de outros países. As informações obtidas serão comparadas com as já conhecidas e depositadas em bases de dados internacionais para avaliar o grau de identidade e, se for o caso, a localização das diferenças que possam existir entre a sequência espanhola e os demais dados internacionais. Tudo isso permitirá a realização de estudos de rastreabilidade do surto, bem como a possível identificação de sua origem.
Fonte: ISCIII
